职称 教授

学位 博士

邮箱 hejin@mail.hzau.edu.cn

研究方向 微生物代谢调控机制研究

 教育经历

1985.09-1989.07，华中农业大学，农学学士

1985.09-1989.07，华中农业大学，农学硕士

1999.09-2003.07，华中农业大学，理学博士

主要职历

1989.07-1991.08，武汉双凤柠檬酸有限公司，技术员

1994.07-现在，华中农业大学生命科学技术学院，历任讲师、副教授、教授（三级岗）

2006.12-2008.03，伊利诺伊大学香槟分校（美国），博士后/访问学者

科研成果

科研方向

主要研究方向为微生物功能基因组学，细菌核苷类第二信使分子及非编码RNA的功能、全局性细菌代谢调控等。近年来，研究方向逐渐向合成生物学与肠道微生物方面拓展。主要科研方向包括：（1）从核苷类第二信使分子c-di-GMP、c-di-AMP的基础理论研究入手揭示其对细菌生理功能的调控机制，为有益微生物的利用及有害微生物的防治奠定基础；（2）研究非编码RNA，如anti-sense RNA、6S RNA及tmRNA等的调控机制，为改造与利用细菌奠定基础；（3）合成生物学调控元件的开发；（4）肠道微生物菌群及结直肠癌的相关研究。

学术成绩

长期从事微生物功能基因组学研究，发表SCI论文60余篇，其中一篇被推荐为F1000Prime论文。论文被引用1500余次。近5年来的研究工作主要集中在核苷类第二信使分子的调控机制方面：系统地揭示了苏云金芽胞杆菌中c-di-GMP代谢酶的功能；首次揭示了c-di-AMP影响苏云金芽胞杆菌芽胞形成的机理；首次发现自然界的三串联开关并阐明了其调控机制；揭示了c-di-GMP核糖开关（riboswitch）的调节方式为“抑制-去抑制”模式；揭示了c-di-AMP的riboswitch通过调节kdpFABC操纵子调控细菌中钾离子转运的机理。

主持科研项目

1.国家自然科学基金面上项目，苏云金芽胞杆菌中Hfq同时调节c-di-GMP与c-di-AMP信号系统的分子机制（31970074），2020-2023，58万元

2.国家重点研发计划项目子课题，畜禽废弃物转化过程中主要(病原)细菌的消减、迁移规律及环境效应研究（2018YFD0500204），2018-2020，35万元

3.国家自然科学基金面上项目，c-di-GMP核糖开关Bc1RNA介导的蜡样芽胞杆菌群细菌趋化性调节新机制（31770087），2018-2021，55万元

4.中央高校基本科研业务费专项资金生物医学研究专项，肠道微生物调控直肠癌新辅助放疗的疗效及毒性研究（2662017PY112），2017-2019，35万元，已结题

5.国家自然科学基金面上项目，c-di-AMP候选受体蛋白TerD的结构功能及其信号途径研究（31270105），2013-2016，78万元，已结题

6.863计划子课题，苏云金芽胞杆菌cry5B基因在淡紫拟青霉中的遗传转化及生防活性研究（2011AA10A205），2011-2015，80万元，已结题

7.973计划子课题，病毒及病害调控的候选药物与分子靶标（2010CB126105），2012-2014，50万元，已结题

8.国家自然科学基金面上项目，水稻黄单胞菌新型烯酰-ACP还原酶FabV晶体结构及其催化机理的研究（31070065），2011-2013，33万元，已结题

代表性学术论文（^*通讯作者，^#并列第一作者）

1. Jin He^{*, #}, Wen Yin^#, Michael Y. Galperin^*, Shan-Ho Chou^*. Cyclic di-AMP, a second messenger of primary importance: tertiary structures and binding mechanisms. Nucleic Acids Research, 2020, doi: 10.1093/nar/gkaa112.

2. Siyang Xu^#, Wen Yin^#, Yuling Zhang, Qimei Lv, Yijun Yang, Jin He^*. Foes or friends? Bacteria enriched in the tumor microenvironment of colorectal cancer. Cancers, 2020, 12(2): 00372.

3. Cao Zheng, Zhaoqing Yu, Cuiying Du, Yujing Gong, Wen Yin, Xinfeng Li, Zhou Li, Ute Römling, Shan-Ho Chou, Jin He^*. 2-Methylcitrate cycle: a well-regulated controller of Bacillus sporulation. Environmental Microbiology, 2020(3): 1125–1140.

4. Xun Wang, Xia Cai, Hongdan Ma, Wen Yin, Li Zhu, Xinfeng Li, Heon M. Lim, Shan-Ho Chou, Jin He^*. A c-di-AMP riboswitch controlling kdpFABC operon transcription regulates the potassium transporter system in Bacillus thuringiensis. Communications Biology, 2019, 2:151.

5. Yang Fu, Zhaoqing Yu, Shu Liu, Bo Chen, Li Zhu, Zhou Li, Shan-Ho Chou, Jin He^*. C-di-GMP regulates various phenotypes and insecticidal activity of Gram-positive Bacillus thuringiensis. Frontiers in Microbiology, 2018, 9: 0045. (recommended as the F1000Prime paper)

6. Xinfeng Li^#, Han Mei^#, Fang Chen, Qing Tang, Zhaoqing Yu, Xiaojian Cao, Binda Tembeng Andongma, Shan-Ho Chou, Jin He^*. Transcriptome landscape of Mycobacterium smegmatis. Frontiers in Microbiology, 2017, 8: 2505.

7. Maria Kanwal Ali, Xinfeng Li, Qing Tang, Xiaoyu Liu, Fang Chen, Jinfeng Xiao, Muhammad Ali, Shan-Ho Chou, Jin He^*. Regulation of inducible potassium transporter KdpFABC by KdpD/KdpE two-component system in Mycobacterium smegmatis. Frontiers in Microbiology, 2017, 8: 570.

8. Hang Zhou^#, Cao Zheng^#, Jianmei Su^#, Bo Chen, Yang Fu, Yuqun Xie, Qing Tang, Shan-Ho Chou, Jin He^*. Characterization of a natural triple-tandem c-di-GMP riboswitch and application of the riboswitch-based dual-fluorescence reporter. Scientific Reports, 2016, 6: 20871.

9. Cao Zheng, Yang Ma, Xun Wang, Yuqun Xie, Maria Kanwal Ali, Jin He^*. Functional analysis of the sporulation-specific diadenylate cyclase CdaS in Bacillus thuringiensis. Frontiers in Microbiology, 2015, 6: 908.

10. Qing Tang, Yunchao Luo, Cao Zheng, Kang Yin, Maria Kanwal Ali, Xinfeng Li, Jin He^*. Functional analysis of a c-di-AMP-specific phosphodiesterase MsPDE from Mycobacterium smegmatis. International Journal of Biological Sciences, 2015, 11(7): 813-824.

11. Qing Tang, Xinfeng Li, Tingting Zou, Huimin Zhang, Yingying Wang, Rongsui Gao, Zhencui Li, Jin He^*, Youjun Feng*. Mycobacteria smegmatis BioQ defines a new regulatory network for biotin metabolism. Molecular Microbiology, 2014, 94 (5): 1006-1023.

12. Shumeng Zhang, Jieping Wang, Yale Wei, Qing Tang, Maria Kanwal Ali, Jin He^* Heterologous expression of VHb can improve the yield and quality of biocontrol fungus Paecilomyces lilacinus, during submerged fermentation. Journal of Biotechnology, 2014, 187, 147-153.

13. Jianmei Su, Lin Deng, Liangbo Huang, Shujin Guo, Fan Liu and Jin He^*. Catalytic oxidation of manganese (II) by multicopper oxidase CueO and characterization of the biogenic Mn oxide. Water Research, 2014, 56, 304-313.

14. Jieping Wang^#, Han Mei^#, Hongliang Qian, Qing Tang, Xiaocui Liu, Ziniu Yu, Jin He^*. Expression profile and regulation of spore and parasporal crystal formation-associated genes in Bacillus thuringiensis. Journal of Proteome Research, 2013, 12(12): 5487-5501.

15. Jieping Wang, Han Mei, Cao Zheng, Hongliang Qian, Cui Cui, Yang Fu, Jianmei Su, Ziduo Liu, Ziniu Yu, Jin He^*. The metabolic regulation of Bacillus thuringiensis for the formation of spores and parasporal crystals revealed by the transcriptomics and proteomics. Molecular and Cellular Proteomics, 2013, 12(5): 1363-1376.

授权发明专利

何进、危雅乐、王阶平、张艳、郝勃. 重组淡紫拟青霉菌株PNVT8及其应用，中国发明专利，ZL201310406991.9.

备注

兼任《Current Bioinformatics》《微生物学杂志》及《生物资源》编委。