“十一五”期间，本实验室发表学术论文共计847篇；其中SCI收录论文492篇（其中以第一完成单位发表SCI论文392篇），出版教材、专著和译著共计45部。其中在J Am Chem Soc、Genome Res、PNAS等影响因子10.0左右的杂志上发表论文7篇；以第一完成单位在J Am Chem Soc、Nucleic Acids Res、Emerg Infect Dis、Plant Physiol、J Biol Chem、Proteomics、J Virol、Mol Microbiol等影响因子5.0-9.0的杂志上发表论文29篇。

“十二五”期间，实验室在国内外学术期刊上发表论文1235篇，其中SCI收录论文840篇（第一署名单位784篇）。以第一署名单位在J Am Chem Soc、Nat Commun、Annu Rev Phytopathol、PNAS、Plant Cell等影响因子10.0左右的杂志上发表论文10篇；在Nucleic Acids Res、Plant Physiol、Emerg Infect Dis、Environ Sci Technol、Environ Microbiol等影响因子5.0～9.0的杂志上发表论文94篇；在Mol Microbiol、J Biol Chem、J Virol、Appl Environ Microb、J Proteome Res等影响因子3.0～5.0的杂志上发表论文338篇；出版专著译著教材等32部。