职称 教授，硕士/博士生导师
学位 博士
政治面貌 中共党员
电话 027-87283455
邮箱 jszheng@mail.hzau.edu.cn
研究方向 基因组学、微生物组学
教育经历
(1) 2006/09-2014/06，华中农业大学，微生物学，硕、博士
(2) 2002/09-2006/06，武汉理工大学，生物技术，学士
主要工作和研究经历
(1) 2022/12-至今，华中农业大学信息学院，教授
(2) 2016/07-2022/12，华中农业大学信息学院，副教授
(3) 2014/07-2016/06，华中农业大学，植物保护，博士后
科研情况
主持项目
(1) 国家自然科学基金面上项目，基于基因组学的芽胞杆菌科的分类、生态与进化研究，2020/01-2023/12，58万，在研，主持
(2) 国家自然科学基金面上项目，苏云金芽胞杆菌H-血清型决定的遗传基础研究， 2018/01-2021/12，64万，在研，主持
(3) 国家自然科学基金青年基金，基于基因组学的苏云金芽胞杆菌资源的多样性研究, 2016/01-2018/12，18万，已结题，主持
主要成果
主要围绕农业有益微生物资源的发掘与利用的关键环节打造数据链并且创新研究方法，实现农业微生物资源的精准化发掘与智能化应用。主要成果包括：（1）开发出新型农业微生物资源发掘的生物信息平台，建立了目前已知的世界上规模最大的以芽胞杆菌为代表的杀虫微生物种质资源库和功能基因资源库；构建了多种植物寄生线虫染色体级别基因组和植物寄生线虫ENCODE库，揭示了我国根结线虫群体多样性与流行趋势；推动了国际上首个杀植物寄生线虫的苏云金芽胞杆菌农药成功上市。（2）彻底厘清了原乳酸杆菌属的分类学问题，揭示了罗伊氏乳杆菌与脊椎动物共演化的机制、及其改善乳猪肠道健康的生态机制，为乳酸菌资源在畜禽养殖业的有针对性发掘提供了理论基础。以第一或通讯（含共同）作者身份在Nature Communications、Microbiome、mBio、Journal of Hazardous Materials、BMC Biology和Bioinformatics等期刊发表SCI论文20余篇，单篇被引超过1900次；主持国家自然科学基金3项，博士后基金2项。
代表性论文
(1) Dai D#, Xie C#, Zhou Y, Bo D, Zhang S, Mao S, Liao Y, Cui S, Zhu Z, Wang X, Li F, Peng D*, Zheng J*, Sun M*. 2023.Unzipped chromosome-level genomes reveal allopolyploid nematode origin pattern as unreduced gamete hybridization. Nat Commun, Accept.
(2) Zhang D#, Li X#, Wu Y, Xu X, Liu Y, Shi B, Peng Y, Dai D, Sha Z*, Zheng J*. 2023. Microbe-driven elemental cycling enables microbial adaptation to deep-sea ferromanganese nodule sediment fields. Microbiome, 11(1):160.
(3) Jin X, Liu S, Zhang Z, Liu T, Li N, Liang Y, Zheng J*, Peng N*. 2023. Enrofloxacin-induced transfer of multiple-antibiotic resistance genes and emergence of novel resistant bacteria in red swamp crayfish guts and pond sediments. J Hazard Mater, 443(Pt B):130261.
(4) Li F, Li X, Cheng CC, Tollenaar S, Simpson DJ, Tasseva G, Perez-Muñoz ME, Frese S, Gänzle MG*, Walter J*, Zheng J*. 2023. A phylogenomic analysis of Limosilactobacillus reuteri reveals ancient and stable evolutionary relationships with rodents and birds and zoonotic transmission to humans. BMC Biol, 21(1):53.
(5) Liu H, Zheng J*, Bo D, Yu Y, Ye W, Peng D, Sun M*. 2022. BtToxin_Digger: a comprehensive and high-throughput pipeline for mining toxin protein genes from Bacillus thuringiensis. Bioinformatics, 38(1):250-251.
(6) Zheng J#, Wittouck S#, Salvetti E#, Franz C, Harris HM, Mattarelli P, O’Toole PW, Pot B, Vandamme P, Walter J, Watanabe K, Wuyts S, Felis GF*, Gänzle MG*, Lebeer S #. 2020. A taxonomic note on the genus Lactobacillus: Description of 23 novel genera, emended description of the genus Lactobacillus Beijerink 1901, and union of Lactobacillaceae and Leuconostocaceae. Int J Syst Evol Microbiol, 70(4):2782-2858. (ESI高被引，2021年ESI热点论文，被引超过1900次)
(7) Wang W#, Hu H#, Zijlstra R, Zheng J*, Gänzle M*. 2019. Metagenomic Reconstructions of Gut Microbial Metabolism in Weanling Pigs. Microbiome, 7(1):48.
(8) Zheng J, Gao Q, Liu L, Liu H, Wang Y, Peng D, Ruan L, Raymond B, Sun M*. 2017. Comparative Genomics of Bacillus thuringiensis Reveals a Path to Specialized Exploitation of Multiple Invertebrate Hosts. mBio, 8 (4):e00822-17.
(9) Zheng J, Gänzle MG, Lin XB, Ruan L, Sun M*. 2015. Diversity and dynamics of bacteriocins from human microbiome. Environ Microbiol, 17(6): 2133–2143.
(10) Zheng J, Ruan L, Sun M, Gänzle MG*. 2015. Genomic analysis of lactobacilli and pediococci demonstrates that phylogeny matches ecology and physiology. Appl Environ Microbiol, 81(20): 7233-7243.
