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何进
发布人:发布时间:2020-03-31



职称 教授

学位 博士

邮箱 hejin@mail.hzau.edu.cn

研究方向 微生物代谢调控机制研究

 

 教育经历

1985.09-1989.07,华中农业大学,农学学士

1985.09-1989.07,华中农业大学,农学硕士

1999.09-2003.07,华中农业大学,理学博士

 

主要职历

1989.07-1991.08,武汉双凤柠檬酸有限公司,技术员

1994.07-现在,华中农业大学生命科学技术学院,历任讲师、副教授、教授(三级岗)

2006.12-2008.03,伊利诺伊大学香槟分校(美国),博士后/访问学者

 

科研成果

科研方向

主要研究方向为微生物功能基因组学,细菌核苷类第二信使分子及非编码RNA的功能、全局性细菌代谢调控等。近年来,研究方向逐渐向合成生物学与肠道微生物方面拓展。主要科研方向包括:(1)从核苷类第二信使分子c-di-GMPc-di-AMP的基础理论研究入手揭示其对细菌生理功能的调控机制,为有益微生物的利用及有害微生物的防治奠定基础;(2)研究非编码RNA,如anti-sense RNA6S RNAtmRNA等的调控机制,为改造与利用细菌奠定基础;(3)合成生物学调控元件的开发;(4)肠道微生物菌群及结直肠癌的相关研究。

 

学术成绩

长期从事微生物功能基因组学研究,发表SCI论文60余篇,其中一篇被推荐为F1000Prime论文。论文被引用1500余次。近5年来的研究工作主要集中在核苷类第二信使分子的调控机制方面:系统地揭示了苏云金芽胞杆菌中c-di-GMP代谢酶的功能;首次揭示了c-di-AMP影响苏云金芽胞杆菌芽胞形成的机理;首次发现自然界的三串联开关并阐明了其调控机制;揭示了c-di-GMP核糖开关(riboswitch)的调节方式为抑制-去抑制模式;揭示了c-di-AMPriboswitch通过调节kdpFABC操纵子调控细菌中钾离子转运的机理。

 

主持科研项目

1.国家自然科学基金面上项目,苏云金芽胞杆菌中Hfq同时调节c-di-GMPc-di-AMP信号系统的分子机制(31970074),2020-202358万元

2.国家重点研发计划项目子课题,畜禽废弃物转化过程中主要(病原)细菌的消减、迁移规律及环境效应研究(2018YFD0500204),2018-2020,35万元

3.国家自然科学基金面上项目,c-di-GMP核糖开关Bc1RNA介导的蜡样芽胞杆菌群细菌趋化性调节新机制(31770087),2018-202155万元

4.中央高校基本科研业务费专项资金生物医学研究专项,肠道微生物调控直肠癌新辅助放疗的疗效及毒性研究(2662017PY112),2017-201935万元,已结题

5.国家自然科学基金面上项目,c-di-AMP候选受体蛋白TerD的结构功能及其信号途径研究(31270105),2013-201678万元,已结题

6.863计划子课题,苏云金芽胞杆菌cry5B基因在淡紫拟青霉中的遗传转化及生防活性研究(2011AA10A205),2011-201580万元,已结题

7.973计划子课题,病毒及病害调控的候选药物与分子靶标(2010CB126105),2012-201450万元,已结题

8.国家自然科学基金面上项目,水稻黄单胞菌新型烯酰-ACP还原酶FabV晶体结构及其催化机理的研究(31070065),2011-201333万元,已结题



代表性学术论文(*通讯作者,#并列第一作者)

1. Jin He*, #, Wen Yin#, Michael Y. Galperin*, Shan-Ho Chou*. Cyclic di-AMP, a second messenger of primary importance: tertiary structures and binding mechanisms. Nucleic Acids Research, 2020, doi: 10.1093/nar/gkaa112.

2. Siyang Xu#, Wen Yin#, Yuling Zhang, Qimei Lv, Yijun Yang, Jin He*. Foes or friends? Bacteria enriched in the tumor microenvironment of colorectal cancer. Cancers, 2020, 12(2): 00372.

3. Cao Zheng, Zhaoqing Yu, Cuiying Du, Yujing Gong, Wen Yin, Xinfeng Li, Zhou Li, Ute Römling, Shan-Ho Chou, Jin He*. 2-Methylcitrate cycle: a well-regulated controller of Bacillus sporulation. Environmental Microbiology, 2020(3): 1125–1140.

4. Xun Wang, Xia Cai, Hongdan Ma, Wen Yin, Li Zhu, Xinfeng Li, Heon M. Lim, Shan-Ho Chou, Jin He*. A c-di-AMP riboswitch controlling kdpFABC operon transcription regulates the potassium transporter system in Bacillus thuringiensis. Communications Biology, 2019, 2:151.

5. Yang Fu, Zhaoqing Yu, Shu Liu, Bo Chen, Li Zhu, Zhou Li, Shan-Ho Chou, Jin He*. C-di-GMP regulates various phenotypes and insecticidal activity of Gram-positive Bacillus thuringiensis. Frontiers in Microbiology, 2018, 9: 0045. (recommended as the F1000Prime paper)

6. Xinfeng Li#, Han Mei#, Fang Chen, Qing Tang, Zhaoqing Yu, Xiaojian Cao, Binda Tembeng Andongma, Shan-Ho Chou, Jin He*. Transcriptome landscape of Mycobacterium smegmatis. Frontiers in Microbiology, 2017, 8: 2505.

7. Maria Kanwal Ali, Xinfeng Li, Qing Tang, Xiaoyu Liu, Fang Chen, Jinfeng Xiao, Muhammad Ali, Shan-Ho Chou, Jin He*. Regulation of inducible potassium transporter KdpFABC by KdpD/KdpE two-component system in Mycobacterium smegmatis. Frontiers in Microbiology, 2017, 8: 570.

8. Hang Zhou#, Cao Zheng#, Jianmei Su#, Bo Chen, Yang Fu, Yuqun Xie, Qing Tang, Shan-Ho Chou, Jin He*. Characterization of a natural triple-tandem c-di-GMP riboswitch and application of the riboswitch-based dual-fluorescence reporter. Scientific Reports, 2016, 6: 20871.

9. Cao Zheng, Yang Ma, Xun Wang, Yuqun Xie, Maria Kanwal Ali, Jin He*. Functional analysis of the sporulation-specific diadenylate cyclase CdaS in Bacillus thuringiensis. Frontiers in Microbiology, 2015, 6: 908.

10. Qing Tang, Yunchao Luo, Cao Zheng, Kang Yin, Maria Kanwal Ali, Xinfeng Li, Jin He*. Functional analysis of a c-di-AMP-specific phosphodiesterase MsPDE from Mycobacterium smegmatis. International Journal of Biological Sciences, 2015, 11(7): 813-824.

11. Qing Tang, Xinfeng Li, Tingting Zou, Huimin Zhang, Yingying Wang, Rongsui Gao, Zhencui Li, Jin He*, Youjun Feng*. Mycobacteria smegmatis BioQ defines a new regulatory network for biotin metabolism. Molecular Microbiology, 2014, 94 (5): 1006-1023.

12. Shumeng Zhang, Jieping Wang, Yale Wei, Qing Tang, Maria Kanwal Ali, Jin He* Heterologous expression of VHb can improve the yield and quality of biocontrol fungus Paecilomyces lilacinus, during submerged fermentation. Journal of Biotechnology, 2014, 187, 147-153.

13. Jianmei Su, Lin Deng, Liangbo Huang, Shujin Guo, Fan Liu and Jin He*. Catalytic oxidation of manganese (II) by multicopper oxidase CueO and characterization of the biogenic Mn oxide. Water Research, 2014, 56, 304-313.

14. Jieping Wang#, Han Mei#, Hongliang Qian, Qing Tang, Xiaocui Liu, Ziniu Yu, Jin He*. Expression profile and regulation of spore and parasporal crystal formation-associated genes in Bacillus thuringiensis. Journal of Proteome Research, 2013, 12(12): 5487-5501.

15. Jieping Wang, Han Mei, Cao Zheng, Hongliang Qian, Cui Cui, Yang Fu, Jianmei Su, Ziduo Liu, Ziniu Yu, Jin He*. The metabolic regulation of Bacillus thuringiensis for the formation of spores and parasporal crystals revealed by the transcriptomics and proteomics. Molecular and Cellular Proteomics, 2013, 12(5): 1363-1376.


授权发明专利

何进、危雅乐、王阶平、张艳、郝勃. 重组淡紫拟青霉菌株PNVT8及其应用,中国发明专利,ZL201310406991.9.

 

备注

兼任Current Bioinformatics》《微生物学杂志》及《生物资源》编委。


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